[7]如论中云：“是心从本以来，自性清净而有无明，为无明所染，有其染心，虽有染心，而常恒不变。”此引语清楚表明生灭门的真如（如来藏）自性清净，为无明染法所染，即具自性相与覆障相。

　　[8]论中谈本觉随染分别有二相，实指始觉；其二相的智净相，即相应于法身；不思议业相，即相应于报身、应身。这就是真如（如来藏）出缠，即出离相。

　　[9]慧远法师认为阿黎耶识就是真识，是如来藏（《大乘起信论义疏》，大正藏卷44）；而元晓、法藏法师认为是染净合流（元晓：《起信论疏》及《大乘起信论别记本》；法藏：《大乘起信论义记》；大正藏卷44）。

　　[10]印顺法师认为如来藏是一切诸法之依，而不是直接的因，如说如来藏“是无为法，不可以说生”，“只能说‘依如来藏’，为依为持为建立”（《大乘三系教判》p29，《印顺集》，黄夏年主编，中国社会科学出版社）。唯识学更广明此理。

　　[11]一般认为“唯心所作”的心指如来藏，但如来藏是无为法，不可能有造作。又心能生能灭，必是有为。故说生万法的心是造作性，是不觉性，由此虚妄染心而有诸法的生灭。这实际就是唯识思想。

　　[12]这与唯识相似，有为法是有为法的直接原因。但唯识学认为无为法只是疏增上缘，没有揭示出真如与无明染法的不一不异的关系是染净法缘起的根本前提。

　　[13]此显现与唯识义见周贵华：《了别与显现》，第二届玄奘国际学术讨论会论文集。

　　[14]《成唯识论》卷一说：“谓空、无我所显真如，有无俱非，心言路绝，与一切法非一非异等。是法真理，故名法性。……”《成唯识论》卷九曰：“真谓真实，显非虚妄；如谓如常，表无变异。谓此真实于一切位常如其性，故曰真如。

　　[15]无著：《摄大乘论本》，玄奘译，《大正藏》卷31。

　　[16]世亲：《摄大乘论释》卷第五，玄奘译，《大正藏》卷31。

　　[17]见无著《摄大乘论本》卷上，玄奘译，《大正藏》卷31。由于唯识学以阿赖耶识为根本建立杂染法的流转与还灭，就将非阿赖耶识摄入阿赖耶识，而仅称阿赖耶识；直到转依发生，阿赖耶识灭尽，才舍阿赖耶识名，转称第八净识，即无垢识。