在生灭门中，还依始觉义建立了还灭的次第，即从不觉到始觉回到本觉的修行次第。首先，相应于前述三细六粗、意意识相区分了六种染心。接着，安立对治六染的修行次第，最终成就如来三身。

　　在生灭门中，真如（如来藏）作为无为法，是生灭之根本，但对诸法的缘起是远因，而近因是有为法。如染法流转是由于真如与无明二者和合，直接原因却是无明；又如真如自体相是还灭的内在原因，是成佛的可能性，但还灭过程的直接原因是对治六染的修行即闻思修之熏习[12]。

　　（四）熏习

　　缘起和还灭依赖于熏习。在《起信论》中，有两类熏习，即同性熏习与异性熏习。同性熏习者，指有为法间的熏习，而且是杂染熏杂染、清净熏清净，必具三义乃成：能熏、所熏及熏留之气分（习气种子）。异性熏习者，指无为法与有为法间的熏习，且是杂染清净相熏。此熏习只有能熏所熏，不立习气种子。

　　此二熏习建立的根据是不生灭与生灭和合相续而转。依不生灭与生灭和合，有异性熏习。不生灭是如来藏（心），生灭是生灭心。由生灭心系摄不生灭如来藏，使如来藏在缠（所谓真如“有染相”），染法生起，名无明熏真如；由如来藏系摄生灭心，而生灭心有灭，如来藏可出缠（所谓真如“有净用”），名真如熏无明。又，依如来藏与生灭心和合相续而转，成立同性熏习。“相续而转”义指生灭心。于生灭心前灭后生、相似相续中有为法间的熏习，如妄心熏习等，是同性熏习。同性熏习必有习气种子，但《起信论》的生灭心主要谈不觉义，即无明是染心的近因的问题，而不是说明一切现行的缘起道理，故在论中隐而不提。

　　依此二熏习义，《起信论》安立两支熏习，即顺净法熏习与顺染法熏习。由此二支熏习，建立缘起和还灭，染法、净法起不断绝。

　　在生灭门中，顺染法熏习建立缘起。此熏习有二；根本不觉熏习及枝末不觉熏习。根本不觉熏习即无明熏真如。此中，无明本指一切心识的不觉相，这里指本识的根本无明，故亦可指本识。如来藏自性清净心，具足净法，由无明染法而在缠，即被无明染法所系摄，与之不一不异，不即不离，和合俱转。从如来藏本净而有生灭流转角度，说本净的如来藏为无明染法所熏习，而被染污、覆障。由无明覆障如来藏，即无明系摄如来藏俱转，为“一切染因”，而有妄心生起。枝末不觉熏习者，即论中所说妄心与妄境界熏习。

　　在生灭门中，顺净法熏习建立还灭。又分为根本净法熏习和对向净法熏习两种。根本净法熏习即是真如熏习，为成佛的正因。此中，真如熏习有二：真如自体相熏习与真如用熏习。此处真如自体相者，指在缠的如来藏。真如自体相熏习无明，即真如系摄无明染法俱转故，无明染法虽能生起，但刹那即灭，虚伪如幻，而容有对治法生起，乃至无明可从厚到薄最后灭尽。从此角度，说真如（如来藏）熏习无明。此即是真如自体相熏习。显然，此自体相熏习为成佛的内在原因和必要条件。但仅此还不够，还需外缘，内因、外缘缺一不可，二者具足，才能转上修行之路。外缘者，即真如用熏习。此处真如，即是出缠如来藏。如来藏出缠，三身成就，不可思议大用显现，一切如来教法从此流出。此真如（出缠如来藏）的大用，熏习有缘众生。于是，以真如自体相熏习为因，真如用熏习为缘，而生起对向净法心，发起修行。对向净法熏习者，即论中所说的（修行的）妄心熏习。此妄心（由《起信论》将成佛前所生诸法皆称为妄得名）虽在妄位，却能引如来藏真如出缠。

　　从前述两支熏习容易看出，无明熏真如是一切染法缘起的根本；反之，真如（自体）熏无明亦是还灭的内在原因；其余熏习则是缘起还灭的引发条件。

二、唯识学中的相关名相

　　如上所述，《起信论》的中心概念是真如、如来藏、熏习等，下面就简单说明一下唯识学的相关概念，以利于二者的会通。需要指出，本文只讨论玄奘法师所译传的唯识学，而不涉及真谛法师所译传者。

　　（一）唯识

　　唯识学的基本思想是“唯识无境”。没有外境，只有内识。识即显现：虽非外境，而显现为外境；虚伪不实，刹那生灭。这里，一切有为诸法皆是识，故唯识；圆成实性是识的实性，与识不一不异，不离于识，故唯识[13]。进一步，在唯识学中识就是心，如“三界唯心”所示，一切诸法唯心。此中，唯识、唯心、唯显现，三者等义。

　　（二）真如与如来藏

　　在唯识学中，真如是统摄一切法相的五法之一。它是二无我所显，离分别，离言，真实，恒常，与一切法不一不异；是诸法之共相理，称法性；还有空性、实际、无相、圆成实性等异名[14]。

　　在唯识学的传统诠释中，真如仅指凝然不动的理性。但依照定义，凡符合“二无我所显”者，皆属真如义。显然，清净有为法为无我所摄，定为真如所摄。于是，真如具摄有为、无为一切净法。不过，在涉及唯识学时，真如的基本义还是指无为之理性。