南无常住十方佛 南无常住十方法 南无常住十方僧(各一拜) 
   
　　南无本师释迦牟尼佛(一拜) 
   
　　南无药师琉璃光如来(三拜) 
   
　　南无药师海会诸大圣众(一拜)

　　二、称赞如来

　　(礼敬既毕，于佛前长跪合掌，称赞偈云：)

　　归命满月界 净妙琉璃尊 法药救人天 因中十二愿

　　慈悲弘誓广 愿度诸含生 我今申赞扬 志心头面礼

　　三、广修供养

　　(称赞既毕，于佛前长跪合掌，称供养偈云：)

　　愿此香花云 遍满十方界

　　一一诸佛土 无量香庄严

　　具足菩萨道 成就如来香

　　至诚供养大慈大悲药师琉璃光如来及药师海会诸大圣众

　　嗡 啊摩嘎 补迦 嘛尼 叭德嘛 乏及哩 打他嘎打

　　维罗割爹 三蛮打 钵喇洒喇 吽 (三遍)

　　嗡 嘎嘎拿 三叭乏 乏及拉 吽 (三遍)

　　嗡 啊 吽 (三遍)

　　四、忏悔业障

　　往昔所造诸恶业 皆由无始贪瞋痴

　　从身语意之所生 一切我今皆忏悔 (三遍三拜)

　　嗡 洒尔乏 爸叭 达哈拿 乏及喇牙 司乏哈 (三遍)

　　五、诵经

　　诵经之时，跪、立、静坐均可。

　　六、持名

　　药师如来琉璃光 焰网庄严无等伦

　　无边行愿利有情 各遂所求皆不退

　　南无东方净琉璃世界 大慈大悲药师琉璃光如来

　　南无药师琉璃光如来 (一０八遍)

　　南无日光遍照菩萨 (三遍)

　　南无月光遍照菩萨 (三遍)

　　南无十二药叉大将 (三遍)

　　七、持咒(药师灌顶真言49遍或108遍)

　　nā mó bó qié fá dì。pí shā shè。jù lǔ bì liú lí。

　　bō lá pó。hé là shé yě。dá tuō jiē duō yě。

　　ā là hē dì。sān miǎo sān bó tuó yě。dá zhí tuō。

　　ōng。pí shā shì。pí shā shì。pí shā shè。sān mó jiē dì suō hē。

　　其咒发音如下：

　　那摩波嘎瓦爹 比杀逝姑乳 比琉璃 钵拉婆 贺拉佳耶 担他噶多耶 阿拉哈爹 三雅三BIU脱也 DAI啊他 嗡
比杀逝 比杀逝 彼杀社 三目噶爹 梭哈

　　八、回向发愿

　　祈求大慈大悲药师琉璃光如来、及药师海会诸大圣众、不违本誓怜悯有情慈悲加被，令……

　　嗡 司嘛喇 司嘛喇 维嘛拿 洒喇 嘛哈 佳割喇乏 吽 (三遍)

　　勤修清净波罗蜜  恒不忘失菩提心

　　灭除障垢无有余  一切妙行皆成就

　　南无药师会上佛菩萨

　　南无善名称吉祥王如来

　　南无宝月智严光音自在王如来

　　南无金色宝光妙行成就如来

　　南无无忧最胜吉祥如来 

　　南无法海雷音如来

　　南无法海胜慧游戏神通如来

　　南无药师琉璃光如来

　　南无日光遍照菩萨

　　南无月光遍照菩萨

　　奉请：
　　
　　宮毗羅大將　　跋折羅大將
　　
　　迷佉羅大將　　安捺羅大將
　　
　　安怛羅大將　　摩涅羅大將

　　因陀羅大將　　波异羅大將

　　摩呼羅大將　　真達羅大將

　　招度羅大將　　鼻羯羅大將